Comme ses prédécesseurs, Super Smash Bros. for Wii U  utilise un système de combat singulier par rapport à la majorité des jeux de combat. Les joueurs ont un large choix de personnages, et chacun tente de lancer ses adversaires hors de la limite du terrain, dans différentes arènes de combat. Les personnages commencent le jeu avec une barre de dommages à 0 %, et la valeur augmente lorsque reçoivent des coups. Plus le pourcentage sera élevé, plus le personnage touché s’envolera loin et pourra être éjecté hors de l'arène, entraînant la perte d'une vie.

Les personnages peuvent utiliser des objets pour remplacer leurs attaques traditionnelles ; chacun a un effet différent sur les personnages autour de lui. Les objets classiques de la série sont toujours présents mais de nouveaux ont été introduits et certains ont également changé d'apparence et de fonction. Deux variétés d'objets, les Trophées Aide et les Poké Balls, invoquent respectivement des personnages et des Pokémon, et ne peuvent être contrôlés par les joueurs. Bien qu'une grande partie aident le joueur qui les a invoqué, certains peuvent infliger des dommages à n'importe qui ou gêner la visibilité de l'écran de façon globale.

Le jeu dispose de plusieurs modes de jeu différents disponibles dans les deux versions, comme un mode solo et un mode multijoueur hors ligne et en ligne.